基地占地面积793.26亩，按用地性质和功能，整体划分为旱地作物繁育区、水田作物育繁区、水产鱼类育繁区、良种展示区、温室大棚区等五个功能区和一个管理服务中心。基地内土壤为石英质砂土，土层深厚，耕性和透气性好，且有地下河经过基地，有水源保障。基地所在地与广州甘蔗糖业研究所（原轻工业部甘蔗糖业研究所）崖城甘蔗育种场的气候和生态条件基本相似，年平均温度20-26℃，平均日照1300小时，年降水量1653.4毫米，十分适合开展甘蔗、木薯、水稻等农作物杂交育种以及罗非鱼育种与繁殖。

基地于2011年2月开始相关筹备建设工作，计划于2014年建设基本完成并正式投入使用。至2012年11月，已完成土地租赁、基地围墙、大门建设，供水、配电、排灌、温室大棚、罗非鱼良种繁育系统、供电设备等配套工程设施正逐步展开。

基地建成后，可解决我区水稻、玉米、甘蔗、木薯、蔬菜、罗非鱼等南繁育种和冬季种子纯度种植鉴定的稳定用地问题，对促进广西农业科技创新、加快广西现代农业发展具有重要的推动作用。